במחלקה זו בפקולטה לחקלאות מזון וסביבה ע"ש רוברט ה' סמית נלמדת ונחקרת המערכת הסביבתית של הקרקע, המים והאטמוספֵרה בדגש על בית הגידול של הצמח. שני מרכזי מחקר במחלקה: מרכז סיגרם למדעי הקרקע והמים ומרכז ליאו פיקרד לחקר מי תהום.http://departments.agri.huji.ac.il/soils%2Fhebrew.shtml